转录辅助因子对不同特性的核心启动子具有特异性

2022-01-17 01:34:17 来源:
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基因表达辅助表征(transcriptional cofactor, COF)在增强子与残基彼此之间传送基因表达线索,是基因表达介导和基因表达的当前效应器物。虽然已证实某些COF比其他COF更比如说某些残基各种类型,但是并不相同COF对并不相同残基显示单单的内在基因表达的程度尚不明了。在一项新深入研究中会,来自奥地利维也纳生器物外围分子结构病理学深入研究所的深入研究其他部门在黑腹酵母菌S2细胞核中会使用高通量残基活性测定来筛选23个COF介导7.2万个候选当前残基(core promoter, CP)的能力。相关深入研究结果于2019年5月15日Skype刊发在Nature期刊上,论文标题为“Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters”。这些深入研究其他部门观察到当前残基的差异介导,这表明COF与特定各种类型的当前残基彼此之间存在着并不相同的调节比如说或者说“通用性(compatibilities)”。这些功能并不相同的当前残基在TATA盒、河口残基电容(downstream promoter element, DPE)和TCT基序等已知的基因组成员电容上相异地富集,并在内源性位点上显示单单并不相同的染色质特性。或多或少的是,这些当前残基各种类型在它们的H3K4me3和H3K4me1标记上存在并不相同的比较原子量,这表明这些组成员蛋白修饰可能能够区分衍生器物调节表征而不是残基和增强子各种类型的顺式调节电容。这些深入研究其他部门证实在人细胞核和另外两种酵母菌细胞核中会证实了并不相同COF-当前残基通用性的存在。为此,他们发现了分别比如说TATA盒和CpG岛残基的COF。COF和当前残基彼此之间的并不相同通用性能够解释并不相同的增强子如何基因表达地介导并不相同组成员的基因、有所并不相同基因内的可变残基(alternative promoter)和有所并不相同残基内的并不相同基因表达起始位点。综上所述,COF-当前残基通用性可能是酵母菌和人类等并不相同器物种中会并不相同基因表达程序的框架。原始单单处:Haberle V1, Arnold CD1, Pagani M1, et al.Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters.Nature. 2019 May 15. doi: 10.1038/s41586-019-1210-7. [Epub ahead of print]
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